1.打开太阳能热水器进水口；
2.太阳能热水器除垢剂加入到存水箱；
3.自动热循环20-30分钟，使除垢剂溶液充分接触各部位；
4.打开排水口，排干清洗液；
5.将水箱加满水后再循环两分钟；
6.排干循环水，清洗除垢工作完成。
真空管内的水垢会影响加热效率，水垢越厚加热越慢，所以会有太阳能热水器使用时间越长，加热越慢的现象。清洗以后水垢消除，加热时间缩短，节省电费。水垢会占用水箱容积，水垢厚了，能储存的热水量就少了。去除水垢，水箱的热水储存量就能越来越多。
清洗太阳能热水器不仅是一种卫生习惯，更重要的是延长其使用寿命。如果太阳能热水器长时间不进行清洗的话，在热水器的内部就容易形成水垢，由于水垢中存在着多种的化学成分，长期水垢的积累和沉淀使得水中的有害物质不断增加，用这种水洗脸或者是洗浴就会出现皮肤过敏的问题。
太阳能热水器用户不知道，太阳能热水器运用二年以上水箱内都会有一层水污。这是由于水中溶有一定数量的钙镁盐类，如碳酸氢盐、碳酸盐等一同还富含泥沙和有机物等，这些盐类在受热进程中发生物理和化学变化而构成水垢，就像我们用电开水壶烧开水一样久了都会看到有一层水污。水中富含碳酸氢钙在水温添加进程中会分解生成难溶的碳酸钙。